Nội dung câu hỏi của bạn có một số điểm chưa hợp lý, tôi có ý kiến như sau:
1. Theo quy định việc chuyển mục đích sử dụng đất thì người xin chuyển mục đích phải có giấy chứng nhận QSDĐ, ở đây bạn chưa được cấp giấy đỏ nên không thể làm thủ tục xin chuyển mục đích và không nộp tiền chuyển mục đích được.
2. Theo quy định của pháp luật đất đai, một trong các điều kiện được cấp giấy chứng nhận là đất không có tranh chấp hoặc đã được giải quyết xong vấn đề tranh chấp (Điều 50 Luật Đất đai, khoản 1, Điều 48 Nghị định 181/2004/NĐ-CP, Điều 14, 15 Nghị định 84/2007/NĐ-CP). Trường hợp của bạn nếu đất do UBND huyện cấp thì đây là một trong những giấy tờ hợp lệ theo quy định tại khoản 1, Điều 50 Luật Đất đai và theo quy định thì phải thêm 01 điều kiện nữa là đất không tranh chấp.
Do đó, phải đợi giải quyết xong vấn đề tranh chấp mới xác định được đối tượng sử dụng và cấp giấy đỏ cho đối tượng đó.
3. Trường hợp giải quyết xong tranh chấp và bạn là người "thắng cuộc", thì được cấp giấy đỏ, khi đó có thể phải chuyển mục đích sang đất thổ cư mới lập thủ tục xin phép xây dựng (nếu thuộc danh mục phải xin phép). Cơ quan có thẩm quyền cấp giấy phép xây dựng nhà ở riêng lẻ là UBND cấp huyện, cơ quan tiếp nhận hồ sơ thì tùy địa phương, thường là Phòng Quản lý đô thị.
4. Luật Đất đai quy định về đất đai, Luật Nhà ở quy định về nhà ở. Điều 49 của Luật Đất đai quy định về các trường hợp được cấp giấy chứng nhận, đối với hộ gia đình, cá nhân được cụ thể hóa tại Điều 50. Nếu không đáp ứng đầy đủ các quy định thì không được cấp giấy chứng nhận.
