Chào bạn,
Đối với vấn đề thứ nhất mà bạn đang quan tâm, có một số điểm cần lưu ý như sau:
1. Thông tư số 141/2011/TT-BTC được viện dẫn (mà sau đó đã được sửa đổi bởi Thông tư số 57/2014/TT-BTC là văn bản dưới luật, được ban hành trên cơ sở căn cứ Bộ luật lao động 1994 và 2012. Theo quy định tại Bộ luật lao động 1994 và 2012 thì trong trường hợp người lao động do thôi việc hoặc vì các lý do khác mà chưa nghỉ hàng năm hoặc chưa nghỉ hết số ngày nghỉ hàng năm, thì được trả lương những ngày chưa nghỉ.
2. Tuy nhiên, ở Bộ luật lao động 2019 hiện hành thì phần "lý do khác" trong nội dung quy định về nghỉ hàng năm đã bị xóa bỏ. Như vậy, có thể hiểu theo quy định của Bộ luật lao động 2019 thì trừ khi các bên có thỏa thuận khác, việc chi trả lương cho những ngày nghỉ hàng năm chưa sử dụng chỉ áp dụng trong trường hợp thôi việc, mất việc.
3. Theo quy định của Luật ban hành văn bản pháp luật thì trong trường hợp các văn bản quy phạm pháp luật có quy định khác nhau về cùng một vấn đề thì áp dụng văn bản có hiệu lực pháp lý cao hơn.
Từ những cơ sở trên, về nguyên tắc, quy định tại thông tư số 141/2011/TT-BTC về trường hợp được thanh toán tiền bồi dưỡng do yêu cầu công việc, cơ quan, đơn vị không bố trí được thời gian cho cán bộ, công chức nghỉ phép không còn giá trị áp dụng.
Liên quan đến Điều 220.2 của Bộ luật lao động 2019, quy định chỉ đề cập đến "hợp đồng lao động, thỏa ước lao động tập thể, các thỏa thuận khác". Như vậy, việc thanh toán tiền bồi dưỡng do yêu cầu công việc, cơ quan, đơn vị không bố trí được thời gian cho cán bộ, công chức nghỉ phép, nếu có, phải được ghi nhận tại hợp đồng lao động, thỏa ước lao động tập thể, các thỏa thuận khác đã giao kết giữa các bên, không thể tham chiếu đến thông tư số 141/2011/TT-BTC.
Ngoài ra, thông tin để bạn tham khảo thêm là Bộ Tài chính đã tiến hành dự thảo và lấy ý kiến thông tư bãi bỏ Thông tư số 141/2011/TT-BTC và Thông tư số 57/2014/TT-BTC tại Chi tiết góp ý dự thảo (mof.gov.vn).