Theo khoản 3 Điều 14 Thông tư 219/2013/TT-BTC được sửa đổi bởi Điều 9 Thông tư 151/2014/TT-BTC quy định về nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT quy định:
"3. Thuế GTGT đầu vào của tài sản cố định, máy móc, thiết bị, kể cả thuế GTGT đầu vào của hoạt động đi thuê những tài sản, máy móc, thiết bị này và thuế GTGT đầu vào khác liên quan đến tài sản, máy móc, thiết bị như bảo hành, sửa chữa trong các trường hợp sau đây không được khấu trừ mà tính vào nguyên giá của TSCĐ hoặc chi phí được trừ theo quy định của Luật thuế TNDN và các văn bản hướng dẫn thi hành:
- Tài sản cố định chuyên dùng phục vụ sản xuất vũ khí, khí tài phục vụ quốc phòng, an ninh;
- Tài sản cố định, máy móc, thiết bị của các tổ chức tín dụng, doanh nghiệp kinh doanh tái bảo hiểm, bảo hiểm nhân thọ, kinh doanh chứng khoán, cơ sở khám, chữa bệnh, cơ sở đào tạo;
- Tàu bay dân dụng, du thuyền không sử dụng cho mục đích kinh doanh vận chuyển hàng hóa, hành khách, kinh doanh du lịch, khách sạn."
Theo khoản 7 và khoản 9 Điều 14 Thông tư 219/2013/TT- BTC quy định về Nguyên tắc khấu trừ thuế Giá trị gia tăng đầu vào, cụ thể như sau:
"7. Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ không chịu thuế GTGThướng dẫn tại Điều 4 Thông tư 219/2013/TT-BTC không được khấu trừ, trừ các trường hợp sau:
a) Thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mà cơ sở kinh doanh mua vào để sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ cung cấp cho tổ chức, cá nhân nước ngoài, tổ chức quốc tế để viện trợ nhân đạo, viện trợ không hoàn lại hướng dẫn tại khoản 19 Điều 4 Thông tư 219/2013/TT-BTC được khấu trừ toàn bộ;
b) Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho hoạt động tìm kiếm, thăm dò, phát triển mỏ dầu khí đến ngày khai thác đầu tiên hoặc ngày sản xuất đầu tiên được khấu trừ toàn bộ."
...
"9. Số thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ, cơ sở kinh doanh được hạch toán vào chi phí để tính thuế TNDN hoặctính vào nguyên giá của TSCĐ.
- Trừ số thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào từng lần có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt.
Tức là: Nếu hóa đơn đầu vào có giá trị từ 20tr trở lên mà không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt: Thì không được khấu trừ thuế GTGT và Không được đưa vào chi phí được trừ khi tính thuế TNDN."
=> Như vậy, trong trường hợp doanh nghiệp của chị thuộc loại hình không chịu thuế GTGT nên khi TSCĐ hình thành trong quá trình mua sắm, xây dựng tài sản cố định, hàng hoá, dịch vụ thì sẽ không được khấu trừ thuế GTGT mà thay vào đó sẽ được hạch toán vào chi phí để tính thuế TNDN hoặc tính vào nguyên giá của TSCĐ
