Giá bán của hàng hoá XNK tại chổ

Xin nhờ luật sư tư vấn cho tôi vấn đề sau:
Công ty tôi (gọi tắt là cty A) là DN 100% vốn nước ngoài. Đang xuất hàng cho 1 công ty ở thái lan (gọi tắt là cty B)nhưng cty này chỉ định giao hàng tại một công ty ở VN (gọi tắt là cty C), theo điều kiện này chúng tôi XK theo hình thức XNK tại chỗ. Vấn đề là giá bán của cty A cho cty B là 800$ nhưng giá bán của cty B cho công ty C lại là 900$. Công ty B yêu cầu cty A làm tờ khai XNK theo giá bán cho cty C là 900$ , Vì như vậy cty C mới có căn cứ để trả đủ số tiền cho cty B.Theo quy định 4 liên của bộ TK XNK này phải có nội dung như nhau . Hải Quan địa phương tôi đã hướng dẫn là sau khi làm xong thủ tục XNK ,cty A sẽ ghi ngay bên dưới giá 900$ giá XK là 800$ bằng với giá thể hiện trên hoá đơn GTGT vào liên dành cho người xuất khẩu và Hải quan sẽ đóng dấu xác nhận.
Việc HQ đóng dấu xác nhận có đúng không ? Công ty tôi làm như vậy đã đúng pháp luật chưa? Có được coi là hợp lệ khi cơ quan thuế đến kiểm tra không?